Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CHCHD4Q8N4Q1 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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