Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SNAPC1Q16533 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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