Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
NPTX1Q15818 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NPTX1Q15818 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.13□□□□□ -2.23
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