Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CUL1Q13616 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CUL1Q13616 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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