Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HDAC1Q13547 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
HDAC1Q13547 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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