Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SKP2Q13309 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SKP2Q13309 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SKP2Q13309 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SKP2Q13309 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SKP2Q13309 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SKP2Q13309 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC0.02□□□□□ -2.41
SKP2Q13309 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SKP2Q13309 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SKP2Q13309 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.01□□□□□ -2.41
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SKP2Q13309 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SKP2Q13309 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SKP2Q13309 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SKP2Q13309 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SKP2Q13309 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SKP2Q13309 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SKP2Q13309 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
SKP2Q13309 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SKP2Q13309 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SKP2Q13309 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SKP2Q13309 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SKP2Q13309 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SKP2Q13309 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SKP2Q13309 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SKP2Q13309 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SKP2Q13309 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SKP2Q13309 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SKP2Q13309 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SKP2Q13309 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SKP2Q13309 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SKP2Q13309 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0□□□□□ -2.41
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SKP2Q13309 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
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SKP2Q13309 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SKP2Q13309 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC0□□□□□ -2.41
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SKP2Q13309 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
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SKP2Q13309 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0□□□□□ -2.41
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SKP2Q13309 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
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SKP2Q13309 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SKP2Q13309 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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SKP2Q13309 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SKP2Q13309 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SKP2Q13309 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SKP2Q13309 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SKP2Q13309 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SKP2Q13309 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
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