Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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FOXF2Q12947 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
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FOXF2Q12947 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
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FOXF2Q12947 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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FOXF2Q12947 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
FOXF2Q12947 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXF2Q12947 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXF2Q12947 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXF2Q12947 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXF2Q12947 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXF2Q12947 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXF2Q12947 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXF2Q12947 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXF2Q12947 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXF2Q12947 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXF2Q12947 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXF2Q12947 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXF2Q12947 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXF2Q12947 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXF2Q12947 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXF2Q12947 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXF2Q12947 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXF2Q12947 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXF2Q12947 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXF2Q12947 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
FOXF2Q12947 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXF2Q12947 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
FOXF2Q12947 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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