Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.4
IFFO1Q0D2I5 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
IFFO1Q0D2I5 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
IFFO1Q0D2I5 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
IFFO1Q0D2I5 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
IFFO1Q0D2I5 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
IFFO1Q0D2I5 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
IFFO1Q0D2I5 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
IFFO1Q0D2I5 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.02□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC0□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC0□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC0□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC0□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC0□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC0□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
IFFO1Q0D2I5 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
IFFO1Q0D2I5 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
IFFO1Q0D2I5 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
IFFO1Q0D2I5 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
IFFO1Q0D2I5 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
IFFO1Q0D2I5 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
IFFO1Q0D2I5 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
IFFO1Q0D2I5 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
IFFO1Q0D2I5 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
IFFO1Q0D2I5 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
IFFO1Q0D2I5 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
IFFO1Q0D2I5 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
IFFO1Q0D2I5 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
IFFO1Q0D2I5 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.5 ms