Protein–RNA interactions for Protein: P28289

TMOD1, Tropomodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1P28289 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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TMOD1P28289 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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TMOD1P28289 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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TMOD1P28289 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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TMOD1P28289 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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TMOD1P28289 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
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TMOD1P28289 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
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TMOD1P28289 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TMOD1P28289 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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