Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC0.47□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC0.47□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC0.47□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
FAM3DQ96BQ1 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
FAM3DQ96BQ1 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
FAM3DQ96BQ1 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
FAM3DQ96BQ1 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
FAM3DQ96BQ1 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
FAM3DQ96BQ1 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
FAM3DQ96BQ1 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
FAM3DQ96BQ1 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
FAM3DQ96BQ1 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
FAM3DQ96BQ1 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
FAM3DQ96BQ1 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
FAM3DQ96BQ1 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
FAM3DQ96BQ1 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
FAM3DQ96BQ1 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
FAM3DQ96BQ1 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
FAM3DQ96BQ1 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
FAM3DQ96BQ1 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
FAM3DQ96BQ1 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
FAM3DQ96BQ1 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
FAM3DQ96BQ1 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162 ms