Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC0.06□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SCN9AQ15858 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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SCN9AQ15858 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
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SCN9AQ15858 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
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SCN9AQ15858 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC0.01□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SCN9AQ15858 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0□□□□□ -2.41
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