Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SURF1Q15526 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SURF1Q15526 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SURF1Q15526 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SURF1Q15526 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SURF1Q15526 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SURF1Q15526 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SURF1Q15526 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SURF1Q15526 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SURF1Q15526 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SURF1Q15526 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SURF1Q15526 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SURF1Q15526 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
SURF1Q15526 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
SURF1Q15526 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SURF1Q15526 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SURF1Q15526 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SURF1Q15526 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SURF1Q15526 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SURF1Q15526 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SURF1Q15526 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SURF1Q15526 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SURF1Q15526 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SURF1Q15526 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SURF1Q15526 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SURF1Q15526 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SURF1Q15526 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SURF1Q15526 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SURF1Q15526 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SURF1Q15526 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SURF1Q15526 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SURF1Q15526 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SURF1Q15526 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SURF1Q15526 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SURF1Q15526 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SURF1Q15526 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SURF1Q15526 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SURF1Q15526 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SURF1Q15526 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SURF1Q15526 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SURF1Q15526 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms