Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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GBX1Q14549 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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GBX1Q14549 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
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GBX1Q14549 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
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GBX1Q14549 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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GBX1Q14549 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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GBX1Q14549 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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GBX1Q14549 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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GBX1Q14549 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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GBX1Q14549 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GBX1Q14549 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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