Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
APOFQ13790 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
APOFQ13790 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
APOFQ13790 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
APOFQ13790 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
APOFQ13790 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
APOFQ13790 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
APOFQ13790 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
APOFQ13790 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
APOFQ13790 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
APOFQ13790 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
APOFQ13790 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
APOFQ13790 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
APOFQ13790 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
APOFQ13790 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
APOFQ13790 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
APOFQ13790 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
APOFQ13790 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
APOFQ13790 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
APOFQ13790 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
APOFQ13790 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
APOFQ13790 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
APOFQ13790 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
APOFQ13790 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
APOFQ13790 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
APOFQ13790 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
APOFQ13790 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
APOFQ13790 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
APOFQ13790 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
APOFQ13790 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
APOFQ13790 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
APOFQ13790 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
APOFQ13790 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
APOFQ13790 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
APOFQ13790 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
APOFQ13790 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
APOFQ13790 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
APOFQ13790 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
APOFQ13790 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
APOFQ13790 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
APOFQ13790 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
APOFQ13790 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
APOFQ13790 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC0.1□□□□□ -2.39
APOFQ13790 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
APOFQ13790 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
APOFQ13790 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
APOFQ13790 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
APOFQ13790 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
APOFQ13790 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
APOFQ13790 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
APOFQ13790 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
APOFQ13790 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
APOFQ13790 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
APOFQ13790 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
APOFQ13790 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
APOFQ13790 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
APOFQ13790 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.4
APOFQ13790 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
APOFQ13790 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
APOFQ13790 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
APOFQ13790 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
APOFQ13790 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
APOFQ13790 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
APOFQ13790 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
APOFQ13790 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
APOFQ13790 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
APOFQ13790 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
APOFQ13790 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
APOFQ13790 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
APOFQ13790 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
APOFQ13790 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
APOFQ13790 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
APOFQ13790 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
APOFQ13790 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
APOFQ13790 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
APOFQ13790 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
APOFQ13790 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC0.08□□□□□ -2.4
APOFQ13790 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
APOFQ13790 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
APOFQ13790 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
APOFQ13790 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
APOFQ13790 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
APOFQ13790 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
APOFQ13790 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
APOFQ13790 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
APOFQ13790 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
APOFQ13790 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
APOFQ13790 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
APOFQ13790 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
APOFQ13790 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
APOFQ13790 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
APOFQ13790 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
APOFQ13790 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
APOFQ13790 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
APOFQ13790 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
APOFQ13790 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
APOFQ13790 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
APOFQ13790 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
APOFQ13790 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
APOFQ13790 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
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