Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TTPAP49638 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TTPAP49638 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TTPAP49638 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TTPAP49638 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TTPAP49638 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TTPAP49638 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TTPAP49638 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TTPAP49638 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TTPAP49638 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TTPAP49638 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TTPAP49638 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TTPAP49638 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TTPAP49638 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TTPAP49638 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TTPAP49638 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TTPAP49638 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TTPAP49638 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TTPAP49638 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TTPAP49638 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
TTPAP49638 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TTPAP49638 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TTPAP49638 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
TTPAP49638 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
TTPAP49638 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
TTPAP49638 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TTPAP49638 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
TTPAP49638 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TTPAP49638 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TTPAP49638 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TTPAP49638 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TTPAP49638 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TTPAP49638 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TTPAP49638 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TTPAP49638 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TTPAP49638 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TTPAP49638 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TTPAP49638 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TTPAP49638 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TTPAP49638 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.02□□□□□ -2.41
TTPAP49638 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TTPAP49638 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
TTPAP49638 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
TTPAP49638 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TTPAP49638 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TTPAP49638 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TTPAP49638 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TTPAP49638 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TTPAP49638 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
TTPAP49638 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TTPAP49638 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TTPAP49638 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TTPAP49638 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TTPAP49638 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TTPAP49638 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TTPAP49638 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TTPAP49638 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TTPAP49638 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.03□□□□□ -2.41
TTPAP49638 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
TTPAP49638 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TTPAP49638 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TTPAP49638 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TTPAP49638 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TTPAP49638 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TTPAP49638 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TTPAP49638 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TTPAP49638 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TTPAP49638 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TTPAP49638 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TTPAP49638 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TTPAP49638 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TTPAP49638 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TTPAP49638 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TTPAP49638 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TTPAP49638 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TTPAP49638 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TTPAP49638 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TTPAP49638 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TTPAP49638 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TTPAP49638 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TTPAP49638 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TTPAP49638 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TTPAP49638 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TTPAP49638 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TTPAP49638 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
TTPAP49638 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TTPAP49638 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
TTPAP49638 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
TTPAP49638 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TTPAP49638 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TTPAP49638 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TTPAP49638 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TTPAP49638 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TTPAP49638 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TTPAP49638 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TTPAP49638 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TTPAP49638 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TTPAP49638 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TTPAP49638 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TTPAP49638 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms