Protein–RNA interactions for Protein: P28289

TMOD1, Tropomodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1P28289 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
TMOD1P28289 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TMOD1P28289 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TMOD1P28289 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TMOD1P28289 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TMOD1P28289 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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TMOD1P28289 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TMOD1P28289 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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TMOD1P28289 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
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TMOD1P28289 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TMOD1P28289 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TMOD1P28289 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
TMOD1P28289 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
TMOD1P28289 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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TMOD1P28289 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TMOD1P28289 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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TMOD1P28289 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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TMOD1P28289 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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TMOD1P28289 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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TMOD1P28289 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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TMOD1P28289 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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TMOD1P28289 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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TMOD1P28289 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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TMOD1P28289 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TMOD1P28289 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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