Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Vmn2r25W4VSP2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms