Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm3550W4VSN7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm3550W4VSN7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms