Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z309

Cib2, Calcium and integrin-binding family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib2Q9Z309 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cib2Q9Z309 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cib2Q9Z309 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms