Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mbd1Q9Z2E2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms