Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A5

Ate1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ate1Q9Z2A5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ate1Q9Z2A5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms