Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccne2Q9Z238 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms