Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trip6Q9Z1Y4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trip6Q9Z1Y4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms