Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q5

Clic1, Chloride intracellular channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic1Q9Z1Q5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clic1Q9Z1Q5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms