Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z180

Setbp1, SET-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setbp1Q9Z180 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Setbp1Q9Z180 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Setbp1Q9Z180 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Setbp1Q9Z180 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Setbp1Q9Z180 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Setbp1Q9Z180 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Setbp1Q9Z180 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Setbp1Q9Z180 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Setbp1Q9Z180 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Setbp1Q9Z180 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Setbp1Q9Z180 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Setbp1Q9Z180 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Setbp1Q9Z180 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Setbp1Q9Z180 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Setbp1Q9Z180 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Setbp1Q9Z180 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Setbp1Q9Z180 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Setbp1Q9Z180 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Setbp1Q9Z180 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Setbp1Q9Z180 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Setbp1Q9Z180 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Setbp1Q9Z180 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Setbp1Q9Z180 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Setbp1Q9Z180 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Setbp1Q9Z180 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Setbp1Q9Z180 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Setbp1Q9Z180 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Setbp1Q9Z180 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Setbp1Q9Z180 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Setbp1Q9Z180 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Setbp1Q9Z180 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Setbp1Q9Z180 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Setbp1Q9Z180 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Setbp1Q9Z180 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Setbp1Q9Z180 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Setbp1Q9Z180 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Setbp1Q9Z180 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Setbp1Q9Z180 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Setbp1Q9Z180 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Setbp1Q9Z180 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Setbp1Q9Z180 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Setbp1Q9Z180 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Setbp1Q9Z180 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Setbp1Q9Z180 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Setbp1Q9Z180 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Setbp1Q9Z180 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms