Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog1Q9Z160 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cog1Q9Z160 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog1Q9Z160 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog1Q9Z160 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog1Q9Z160 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog1Q9Z160 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog1Q9Z160 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog1Q9Z160 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog1Q9Z160 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog1Q9Z160 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog1Q9Z160 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog1Q9Z160 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog1Q9Z160 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog1Q9Z160 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog1Q9Z160 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog1Q9Z160 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog1Q9Z160 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog1Q9Z160 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms