Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ap4s1Q9WVL1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms