Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pacsin2Q9WVE8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pacsin2Q9WVE8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms