Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apobec2Q9WV35 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apobec2Q9WV35 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms