Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Opn3Q9WUK7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms