Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrf1Q9WU00 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms