Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp18Q9WTV6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms