Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trpc2Q9R244 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms