Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sorbs3Q9R1Z8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms