Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lhx6Q9R1R0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms