Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Psma4Q9R1P0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Psma4Q9R1P0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms