Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rfwd2Q9R1A8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms