Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Plod3Q9R0E1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms