Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lamc3Q9R0B6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Lamc3Q9R0B6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms