Protein–RNA interactions for Protein: Q9R088

Tk2, Thymidine kinase 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk2Q9R088 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tk2Q9R088 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms