Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Col4a4Q9QZR9 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Col4a4Q9QZR9 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Col4a4Q9QZR9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Col4a4Q9QZR9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Col4a4Q9QZR9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Col4a4Q9QZR9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Col4a4Q9QZR9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a4Q9QZR9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Col4a4Q9QZR9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms