Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Copg1Q9QZE5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copg1Q9QZE5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms