Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
ChmlQ9QZD5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChmlQ9QZD5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms