Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ercc4Q9QZD4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms