Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn8Q9QZ49 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ubxn8Q9QZ49 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms