Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Six6Q9QZ28 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Six6Q9QZ28 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms