Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Phtf1Q9QZ09 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Phtf1Q9QZ09 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms