Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Opn4Q9QXZ9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opn4Q9QXZ9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Opn4Q9QXZ9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Opn4Q9QXZ9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opn4Q9QXZ9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opn4Q9QXZ9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opn4Q9QXZ9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Opn4Q9QXZ9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Opn4Q9QXZ9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opn4Q9QXZ9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opn4Q9QXZ9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opn4Q9QXZ9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opn4Q9QXZ9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opn4Q9QXZ9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opn4Q9QXZ9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn4Q9QXZ9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Opn4Q9QXZ9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn4Q9QXZ9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Opn4Q9QXZ9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms