Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nr2e3Q9QXZ7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms