Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Kcnip3Q9QXT8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Kcnip3Q9QXT8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Kcnip3Q9QXT8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Kcnip3Q9QXT8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Kcnip3Q9QXT8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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